家族亲缘鉴定通常是在没有直系血亲（父母和儿女）的情况下进行的一些鉴定。根据检测所用标记的不同，分为母系亲缘鉴定和父系亲缘鉴定。
母系亲缘鉴定：通过线粒体DNA鉴定外祖母与外孙女或者姨与外甥女之间的关系；同胞兄妹间的亲缘关系。母系亲缘鉴定即通过线粒体DNA鉴定。
由于线粒体是母系遗传，因此，只要是来源于同一个母亲，都是可以使用线粒体DNA进行鉴定的。如鉴定外祖母和外孙女的关系，可以直接采用线粒体，但是如果线粒体结果完全一致时，可以基本确定祖孙关系，但是检测结果有一两个不同，这时候不能轻易排除，因为线粒体比核DNA更容易发生突变，这种差异和不同有可能是突变造成的，也有可能是实际的不同。所以亲缘关系的检测，所下结论必须慎重。
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